A estação de Piratuba foi inaugurada em 29 de outubro de 1910 pela então Cia. Estrada de Ferro São Paulo-Rio Grande quando foi aberta a linha entre Presidente Pena (município de Caçador) e Uruguai (município de Piratuba).
A estação foi fechada e passou a servir de moradia até que em 2003 foi ocupada parcialmente pela ABPF para ser o ponto de partida do Trem das Termas. A partir de 2007, a estação passou a ser inteiramente utilizada.
